巡捕、漕运、备御等事；出征时，各卫率领共属所听从朝廷所派将领的调度。

    每卫大抵5600人，下辖五个千户所，每千户统兵1120人，设千户一人，正五品，副千户二人，从五品，千户、副千户分管军务，一人掌印、一人佥书。镇抚二人（镇抚是专管军纪的官员，百户缺员时可代百户行使职权），从六品。掾属有吏目一人。下辖十个百户所，每百户统兵112人，分为两个总旗。每总旗统兵56人。又分为五小旗，小旗管辖10名士兵。

    所有的军政，由卫下达于千户所，千户督百户，百户下达总旗、小旗，大小联比以成军。洪武二十六年(1393)，定全国都司、卫所，共设都司17个、行都司3个、留守司1个、内外卫329个、守御千户所65个。兵额最多时达270余万人。

    国家一旦遇有战争，由兵部秉承皇帝旨意，委派都督府官或侯伯出任总兵官，事后还任。明初，地方军队领导体制平时和战时不同。平时的军队训练、守御、屯田等都由都指挥、指挥使、千户、百户等层层负责。都指挥是一地区的最高长官。战时由朝廷派出的总兵官，指挥临时调集的某几个卫所或某几个卫所的部分官兵，进行作战。战争结束后，军队各回本卫所。

    总兵是由中央派出的，官爵较高，职权较专。如宣府镇，永乐时总兵官的职掌为：“整饬兵备，申严号令，练抚士卒，振作军威。务要衣甲整齐，器械锋利。城堡墩台坍塌以时修治坚完，官军骑操马匹责令饲养膘壮。仍督屯田粮草，并一应钱粮不许侵欺。遇有贼寇，相机战守”。这就是说练兵作战，筹饷由总兵负责。正统以后，明朝由盛转衰，内忧外患加重。在这种情况下长城防线时时处于戒备状态，被朝廷派遣来的总兵官渐渐变成总领一方军事的固定官职，都指挥使是地方性军事长官，渐渐就成为总兵的下属了。这时期的总兵官被称为镇守。镇守以下，独守一路的称为分守。防守一城一堡的称为守备，与主将同守一城者为协守，总兵又分正、副。下设参将、游击将军等。除此以外又有提督、提调、巡视、备御、领班等名。如镇守蓟州总兵官一人，旧设。隆庆二年改为总理练兵事务兼镇守，驻三屯营，协守副总兵三人，统领南兵游击将军三人，领班游击将军七人，坐管官八人，守备八人，把总一人，提调官二十六人。

    总兵官变成镇守地方的军队统帅后，再有战事时，朝廷又派中央大臣到地方巡抚，事毕复命。久之，巡抚也成为固定的官职，长驻地方。巡抚多以都御史或副佥都御史充任，其基本职能是监察地方，考核官吏，督理税粮，抚安百姓，控扼险要，固守城池等。以后偏重于军事，整饬边备，提督关隘，赞理军务者越来越多。如成化八年（1472）巡抚余子俊于榆林镇督修长城1770余里。

    明朝规定巡抚兼军务者加提督军务，有总兵地方加赞理、管粮饷者加总督兼理等名义。各地巡抚实际上已经掌握一方的民事和军务大权，总兵官、都、布、政三司使都时为巡抚的下属，听其指挥。后来长城防线局势日趋紧张，战争此起彼伏。当时修筑长城，或调兵遣将多涉及几个镇，为调节、辖制各镇，以利统一作战，朝廷又添设总督军务或总制或总理，派重臣出任，有的成了长设之官。

    如弘治十年（1497）在长城防线设置延绥、甘肃、宁夏三边总制（总督），并明确诏令总督文武，自总兵、巡抚而下皆听节制。总督具有了广泛的综合权力，出则为一方军政之首，入则为朝廷显官，巡抚、总兵，地方之司俱听节制，举凡行政、军政、司法、监察之权，无不过问。明末，为阻后金军入关，朝廷又将兵部尚书外出经略，后来又派大学士出来督师，权力又在总督之上。

    明初地方最高军事长官为都指挥，一变而为总兵官，再变而为巡抚，三变而为总督，最后变为督

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