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第1章 序章 前世

第2章 转世与重生，时空的穿梭者

第3章 陌生的世界 新的起点

第4章 波导之力 第一个伙伴

第5章 Mega之石的洞窟

第6章 大木博士的研究所 天魂的初战

第7章 常磐的王者 常磐之力的觉醒

第8章 收服雪拉比 初遇凤王

第9章 Mage路卡利欧VS凤王 天凤之力的觉醒

第10章 王者的实力 与超梦的初遇

第11章 被坑的板木 Mage路卡利欧VSMage大针蜂

第12章 月见山的奇遇 梦幻神奇宝贝蛋

第13章 尼比道馆 冰雪世界

第14章 华蓝市的表演 新的伙伴

第15章 迈向神奇宝贝擂台之路

第16章 神奇宝贝学院的腐朽

第17章 神奇宝贝乡的妙蛙种子

第18章 走失的小火龙

第19章 杰尼龟军团登场!

第20章 收服巨大快龙

第21章 电击对战 枯叶道馆

第22章 蓝普尔其的假日

第23章 巨大快龙VS巨大dú cì水母 小霞的痛

第24章 收服鬼斯

第25章 闪光巴大蝴的魅力

第26章 金黄道馆之战，双打对战！

第27章 险情 米瑞斯！

第28章 彩虹道馆

第29章 索利柏的催眠术

第30章 格斗神奇宝贝大战斗

第31章 浅红道馆的决斗

第32章 决战圣剑士 光之觉醒！

第33章 光VS影

第34章 野生原野区 梦幻出生

第35章 单车路 海之神VS黑暗海之神

第36章 百变怪的小屋 米瑞斯独自作战

第37章 暂时的离别 恶魔的扫荡

第38章 阿和的怀疑 隔阂产生

第39章 决战四天王 奥米加兽

第40章 重回神奇宝贝世界 红莲道馆之战

第41章 假期 火之神的降临

第42章 冰山奇遇

第43章 剧场版超梦的逆袭

第44章 石英联盟 初选赛

第45章 预选赛

第46章 阿尔宙斯降临

第47章 神抵 新的旅行

第48章 新的伙伴

第49章 入学

第50章 旅途开始（女主现身）

第51章 暴龙改造者 大辅被抓

第52章 黑暗魔王 黑暗第一天

第53章 特别篇 黑暗亚古兽

第54章 传闻的光之闪光 黑暗第二天

第55章 守卫 黑暗第三天

第56章 苦战 黑暗第四天

第57章 决战七大魔王 黑暗第五天

第58章 决战黑暗魔王 黑暗第六天

第59章 皇骑的春天 光明第一天

第60章 回归

第61章 皇家骑士团的茶话会

第62章 黑暗之海 奥古杜兽复活

第63章 牺牲 穿越

第64章 举手表决吧各位